Para eliminar as descrenças de alguns, Sakurai confirmou no Smash Bros. Direct que o Super Smash Bros. for 3DS rodará a 60 quadros por segundo mesmo com o 3D ligado. Para que isso ocorra todos os Assist Trophies e Pokémon que saem de Pokeballs terão sua frame rate alterada para 30 quadros por segundo cravados. Assim, todos os jogadores continuarão a 60 quadros por segundo. Sakurai disse que o fato desses ajudantes estarem com uma frame rate menor não alterará a batalha.