Os fãs de Yu-Gi-Oh! comemoram com a localização do novo jogo da série para as Américas, mas esta felicidade pode ser estragada com a percepção de alguns europeus sobre o jogo.
Aparentemente, a versão ocidental teve diversos cortes de conteúdo, começando pela remoção do modo "Device" e "Database", além da exclusão das áreas para visualização dos perfis de duelistas, fotos, imagens de encerramento e da área para reprodução das músicas do jogo. Além disto, o jogo aparenta estar com a dificuldade reduzida, considerando que diversos conteúdos bloqueados são liberados automaticamente com o progresso da história.

Por fim, enquanto o jogo original permite escolher entre 40 personagens jogáveis, apenas 12 estão presentes na versão ocidental. São eles:

- Yuma
- Astral
- ZEXAL
- Tori
- Reginald
- Kite
- Dr. Faker
- Vetrix
- Trey
- Quattro
- Alito
- Konami-kun (também conhecido como Hat Guy)