Em sua coluna semanal na revista Famitsu, Sakurai revela o motivo de não usar o Circle Pad Pro no jogo, a questão surgiu pois o C-stick será suportado no New 3DS.
Sakurai disse:

Fazer uso do CPP exige a utilização de certo poder de processamento da CPU. A partir das informações recebidas durante o desenvolvimento de Kid Icarus: Uprising, este percentual é  muito grande, em torno de 5 %. Kid Icarus: Uprising e Smash Bros, usam a capacidade máxima do aparelho, por isso tivemos que abandonar a ideia de apoio CCP. Com o New 3DS, fomos capazes de suportar o C -Stick, já que o poder de processamento é maior e é parte do hardware, não um acessório.

Super Smash Bros. para 3DS será lançado dia 03/10 e terá um evento especial para o lançamento.